اگرچه موضوع بورسیه‌ها در پایان به یک آبروریزی برای دولت تبدیل شد اما در میانه جنجال‌سازی‌ها، دلسوزان یک نکته را به حسن روحانی یادآوری کردند که او باید نسبت به هزینه‌سازی‌های جریان فتنه برای دولتش هوشیار باشد.

به گزارش خبرگزاری فارس، روزنامه وطن امروز در گزارشی نوشت: آن زمان که فرجی‌دانا در روز استیضاح آن عقب‌نشینی تاریخی را انجام داد و برخلاف فریاد «فرجی افشا کن» هواداران فتنه و دولت، دست‌های خالی خود را به علامت تسلیم بالا برد؛ ماجرای بورسیه‌ها به یک آبروریزی تمام‌عیار برای دولت و فتنه‌گران تبدیل شد تا سهم رسمی فتنه از دولت روحانی در یک‌سالگی دولت شلیک سهمگینی به سوی اعتبار دولت روحانی رها کرده باشد. روحانی در روز استیضاح فرجی‌دانا ترجیح داد به مجلس نرفته و از مدعی بورسیه‌ها دفاع نکند. با این حال حتی اگر این حرکت روحانی هم به معنای عدم تمایل او نسبت به حمایت از فرجی دانا تلقی شود (که اینگونه نیست) اما همراهی حسن روحانی با پروژه اتهام بورسیه‌های غیرقانونی موضوعی نیست که بتوان آن را فراموش کرد. به گزارش «وطن امروز»، دروغ بودن اتهام 3 هزار بورسیه غیرقانونی تنها با عقب‌نشینی فرجی‌دانا در روز استیضاح در مجلس صورت نگرفت بلکه گزارشی که وزارت علوم در زمان فرهادی منتشر کرد، مهر تاییدی بود بر این دروغ؛ دروغی که نه‌تنها افکار عمومی را نسبت به دولت بدبین کرد بلکه جامعه دانشگاهی را نیز نسبت به وزارت علوم بی‌اعتماد کرد. دروغ بورسیه‌ها ظلم بزرگی به اعتبار علمی دانشجویان بود و جامعه دانشگاهی با عده‌ای سیاست‌باز مواجه شدند که برای تخریب رقیب خود، حاضرند اعتبار علمی و زحمات دانشجویان و نخبگان کشور را زیر سوال ببرند. با این حال اما اظهارات شنبه‌شب رهبر انقلاب در دیدار تعدادی از اساتید و هیات‌های علمی دانشگاه‌ها می‌تواند تاحدودی چنگ وزارت علوم دولت یازدهم بر چهره نخبگان کشور را التیام بخشد. رهبر انقلاب در این دیدار به‌عنوان یکی از مصداق‌های سیاست‌بازی در دانشگاه‌ها، به حاشیه‌سازی درباره موضوع بورسیه‌ها اشاره کردند و آن را از غلط‌ترین کارهای چند سال اخیر دانستند. حضرت آیت‌الله خامنه‌ای افزودند: تحقیقات دقیق نشان می‌دهد مساله بورسیه‌ها، به آن شکلی که در روزنامه‌ها با آن بازی کردند، نبود اما اگر هم بود باید از راه‌های قانونی امتیازاتی که عده‌ای برخلاف قانون گرفته بودند لغو می‌شد نه اینکه سر و صدا و جنجال درست شود. رهبر انقلاب سیاست‌بازی را سمِّ محیط‌های علمی خواندند و با ابراز تأسف از اینکه در موضوع بورسیه‌ها به عده‌ای ظلم شد، افزودند: سمّی که در این موضوع به دانشگاه‌ها تزریق شد از بینش فکری مبتنی بر سیاست کاری نشأت می‌گرفت و متأسفانه، هم خلاف قانون، هم خلاف تدبیر و هم خلاف اخلاق بود.

تشکر دانشگاهیان از سخنان رهبر انقلاب
سخنان صریح رهبر انقلاب در مذمت سیاست‌بازی صورت گرفته در ماجرای بورسیه‌ها، همانگونه که انتظار می‌رفت با استقبال جامعه دانشگاهی مواجه شد. در همین راستا شورای هماهنگی دانش‌آموختگان و دانشجویان اقدام به انتشار نامه به منظور تشکر و درد دلی با ایشان کرده است. در ابتدای این نامه آمده است:
«سلام و دعای خیر از طرف 1431 نفر از دانش‌آموختگان و دانشجویان مظلوم بورسیه گروه خادمین نظام و خانواده محترمشان را تقدیم محضر مبارک شما می‌کنیم. دیشب (شنبه‌شب) بیانات گرم و عالمانه شما مرهمی شد برای دل هزاران دانش‌آموخته و دانشجوی بورسیه و خانواده‌های ایشان بویژه دانش‌آموختگان و دانشجویان شاهد و ایثارگر و مربیان دانشگاه‌های مناطق محروم کشور عزیزمان، تا پس از گذشت بیش از یک سال، اشک‌های شوق و امید التیامی باشد بر خون ‌دل پدران، دل‌های شکسته مادران و سرگشتگی و یأس هزاران دانشجو و دانش‌آموخته بورسیه. ما در غربت، زیر سایه سنگین تهمت، پشت درهای بسته عدالت و بی‌هیچ فرصتی برای قضاوت، مدت زیادی است از حقوق قانونی خود محروم شده، آبروی‌مان در فضای مسموم رسانه‌ای به بازی گرفته شده و فریاد تظلم‌خواهی‌مان در حلقوم یکایک‌مان خفه شده است». در این نامه همچنین آمده است: داستان سیاسی بورسیه‌ها که در شمای کلی و عمومی یک برنامه‌ریزی گسترده برای حذف جناح نخبه و مومن در دانشگاه‌ها ارزیابی می‌شود، یکی از حاشیه‌های بی‌پایان وزارت علوم است و امروز تبدیل به مردابی شده که نه‌تنها هزاران دانشجو و دانش‌آموخته مظلوم بورسیه را در خود گرفتار کرده بلکه تمام ارکان نظام را نیز درگیر خود کرده است. امروز دیوار دروغگویان فروریخته و بهانه‌های مدعی مبنی بر انگیزه و دلایل ورود به موضوع نخ‌نما شده است. بهانه‌هایی که برای موجه کردن فعالیت‌های غیرقانونی خود از ابتدای پرونده‌سازی برای بورسیه‌ها استفاده نموده دارای 2 رکن اصلی مبنی بر وجود گزارش‌ها و پیگیری‌های نهادهای نظارتی، دیوان محاسبات کشور و سازمان بازرسی کل کشور بوده است اما سیاهی بر زغال ‌ماند و امروز هر دوی این نهادها این دعاوی را تکذیب کرده‌اند.
در این نامه همچنین خاطرنشان شده است: رهبر عزیزمان همان‌طور که حضرت عالی اشاره کردید ظلمی بزرگ به ما رفت و در یگانه نظام اسلامی جهان به مانند یتیمی بودیم که هیچ مرجع و نهاد قضایی و قانونی نسبت به انجام وظیفه قانونی خود اقدام نمی‌کرد اما امروز به مانند همیشه، یتیم‌نوازی نمودید و دست پرمهر و برکت خود را بر سر ما کشیدید و بیش از پیش ما را دلبسته خویش نمودید. لطف خدای بزرگ و صاحب‌مان حضرت ولی‌‌عصر(عج) همچون همیشه شامل حال ما شد و شما رهبر فرزانه در زمانی که باید، پناهگاه هزاران مظلوم شدید.

مشکل بورسیه‌ها حل شد
پس از بیانات صریح رهبر انقلاب مبنی بر دروغ بودن ادعای 3 هزار بورسیه، محمدعلی پورمختار رئیس کمیسیون اصل 90 مجلس شورای اسلامی گفت مشکل دانشجویان بورسیه طبق توافق وزارت علوم و کمیسیون اصل 90 حل شد.  پورمختار به تسنیم گفت: کمیسیون اصل 90 مجلس طی جلسه‌ای که با وزارت علوم برگزار کرد، به توافق‌هایی رسید و مقرر شد وزارت علوم موضوع بورسیه‌ها را دنبال کند و با توجه به همان نظری که کمیسیون اصل 90 مجلس دارد، مشکلات دانشجویان بورسیه حل شود. وی افزود: باید توجه داشت که تعیین تکلیف تعدادی از دانشجویان بورسیه باقی مانده که حدود 200 نفر‌ند و چون این تعداد از دانشجویان بورسیه حکم بورس نداشته‌اند، باید در دانشگاه‌ها جایابی را انجام دهند تا به‌صورت بورسیه بتوانند ادامه تحصیل دهند. پورمختار ادامه داد: نسبت به مابقی دانشجویان بورسیه تعیین تکلیف شده، یعنی 1600 تا 1700 دانشجوی بورسیه مشکلی نخواهند داشت. رئیس کمیسیون اصل 90 مجلس با اشاره به اینکه براساس توافق کمیسیون اصل 90 مجلس با وزارت علوم قرار شده مشکل دانشجویان بورسیه ایثارگر و مربیان کاملاً حل شود، تصریح کرد: تعدادی از مربیان نیز پیمانی بودند و باید از هیات امنای دانشگاه مربوط مجوز می‌گرفتند که این مربیان باید این پروسه را طی کرده سپس به تحصیل خود ادامه دهند. پورمختار تأکید کرد: از دانشجویان بورسیه‌ای که شرط معدل آنها از سوی وزارت علوم دولت یازدهم ایراد گرفته شده بود، 50 نفر آنها حکم بورس داشتند که این حکم آنها غیرقابل برگشت است و می‌توانند با همان شرایط بورسیه به تحصیل خود ادامه دهند.

خلاف قانون، تدبیر و اخلاق!
اگرچه موضوع بورسیه‌ها همانگونه که گفته شد در پایان به یک آبروریزی برای دولت تبدیل شد اما در میانه جنجال‌سازی‌ها، دلسوزان یک نکته را به حسن روحانی یادآوری کردند که به نظر می‌رسد بار دیگر باید یادآوری شود و آن نکته این است که او باید نسبت به هزینه‌سازی‌های جریان فتنه برای دولتش هوشیار باشد یا به تعبیر عامیانه‌تر مراقب پوست خربزه‌های فتنه باشد. به گزارش «وطن امروز»، متاسفانه حسن روحانی در جایگاه رئیس‌جمهور با ادعای بورسیه‌های غیرقانونی همراهی کرد و حتی می‌توان گفت بار چاق کردن این ادعا را هم بر دوش گرفت. روحانی سال گذشته همزمان با آغاز هفته دولت در مرقد امام خمینی(ره) گفت: دولت در مبارزه با فساد از جمله فساد در دانشگاه و فساد مدارک علمی یا فسادی که در زمینه بورسیه‌ها بوده، جدی خواهد بود و این مبارزه را ادامه خواهیم داد و با تغییر یک نفر از دولت، مسیر دولت تغییر نخواهد کرد بلکه همان مسیری که مردم و آرای مردم برای ما مشخص کرده‌اند، ادامه خواهد یافت. او چندی بعد در جمع نخبگان و برگزیدگان استان خراسان رضوی نیز گفت: متأسفانه به برخی فسادها برخورد کرده‌ایم که شگفت‌آور و حیرت‌آور است؛ آخر برای استاد شدن و بورسیه شدن هم تقلب؟ از فردی که قرار بوده استاد دانشگاه این کشور شود، پرسیده‌اند نمره‌ات چند بوده، در پاسخ نمره‌ای می‌گوید که بعد معلوم می‌شود، اشتباه است. دچار حیرت شده‌ایم چون رانت را نه تنها در حوزه‌های اقتصادی، مالی و پولی بد می‌دانیم بلکه وقتی فردی می‌خواهد استاد و معلم فرزندان مردم شود و برای نجات کشور به تربیت شاگرد اقدام کند، نباید در روندی با تقلب قرار گیرد». روحانی همچنین در آیین آغاز سال تحصیلی دانشگاه‌ها و موسسات آموزش‌عالی نیز که نیمه مهر ماه در دانشگاه تهران برگزار شد، گفت: نمی‌توانیم در یک مساله‌ای که صداقت، راستگویی، دقت و قانون مورد توجه قرار نگرفته است، بی‌توجهی کنیم. کما اینکه اولین کلام با دکتر نجفی در آغاز سرپرستی وی در وزارت علوم این بود که «مساله بورسیه‌ها را باید دنبال کنید». روحانی همچنین در هشتمین همایش ملی نخبگان جوان کشور گفت: بعضی‌ها به ما گفتند وزیر نباید دست به موضوع بورسیه‌ها بزند. در این میان معروف‌ترین اظهارنظر روحانی درباره بورسیه‌ها همان عبارت معروف «بورسیه و ما ادراک البورسیه» است. او مهرماه 93 در دانشگاه تهران با بیان اینکه در طول یک سال ما 4 وزیر و سرپرست را تجربه کردیم، افزود: از آقای میلی‌منفرد خواهش کردیم مسؤولیت وزارت علوم را بپذیرند، دیدیم مجلس شورای اسلامی نپسندید، اشکال ندارد، از آقای توفیقی خواهش کردیم سرپرستی را برعهده بگیرند از یمین و یسار به ما فشار آمد که او را معرفی نکنید، گفتیم اهلا و سهلا سر فرود آوردیم برای اینکه دانشگاه و کشور آرام باشد، آقای دکتر فرجی دانا را آوردیم و ایشان شروع به کار کرد که بورسیه و ما ادراک البورسیه. روحانی با مورد تاکید قرار دادن این موضوع که همه باید به اخلاق علمی توجه کنیم، گفت: ما نمی‌توانیم مساله‌ای را که صداقت و راستگویی و قانون در آن مورد توجه قرار نگرفته رها کنیم. از روز اولی که آقای دکتر فرجی آمدند اولین کلام من این بود که باید مساله‌ بورسیه را دنبال کنید.
متاسفانه این اظهارات و اقدامات روحانی درباره ادعای بورسیه‌ها باعث شد رسانه‌های حامی فتنه و دولت نسبت به پیگیری این موضوع ترغیب و تهییج شوند. اکنون که همه چیز ثابت و دروغ 3 هزار بورسیه آشکار شده است، آیا بهتر نیست آقای روحانی ضمن عذرخواهی از افکار عمومی، نسبت به دلجویی از نخبگان مظلوم اهتمام کند؟ آیا این انتظار، انتظاری غیردلسوزانه است اگر از رئیس‌جمهور خواسته شود حداقل از این به بعد با طناب فتنه درون چاه نرود؟!